ну и повесьте его над столом, если никаких передвижений по мебели не планируете. Жалюзи направите в стену (с окном). Если кондиционер будет мешать работать за столом, поставьте защитный экран. На малых вентилятор будет едва-едва гонять воздух, так что дуть не будет. В современных аппаратах около 5 скоростей вращения, тошиба, митсубиси, дайкин, дженерал, к тому же они тихие.

з.ы. На худой конец, если всё каким-то образом будет дуть, всегда можно оградить кроватку ширмой или занавеской - это не проблема.
Лучше подумайте о влажности в помещении.